2011年9月15日，被免去国家体育总局副局长职务；

2012年，任伦敦奥运会协调委员会委员，中华全国体育总会副主席，中国奥委会副主席，中国赛艇协会主席，中国体育舞蹈协会主席，第29届奥林匹克运动会组织委员会执行副主席；

2016年9月，任北京2022年冬奥会和冬残奥会组织委员会副主席。

2019年10月，于再清卸任国际武术联合会主席一职。

现任国际奥委会委员、中国奥委会副主席、萨马兰奇体育发展基金会创始理事长、成都世运会专家咨询委员会主任。

2019年10月19日，第15届世界武术锦标赛开幕式在上海东方体育中心举行。当天，国际武联代表大会在上海举行并进行换届改选，原国际武联主席于再清卸任。

2024年5月9日，于再清担任成都世运会专家咨询委员会主任，参与指导2025成都世运会的相关工作。

“北京的奥运会筹办工作就有两个大问题，一个是空气质量，另一个是交通。这些事情都是不需要回避的，因为北京奥组委正在加大工作力度，且要在今年8月之前一定做好的事情。”无论是国际奥委会执委的身份，还是奥组委执行副主席的身份，于再清都十分关注北京的空气质量和交通问题。

从国际奥委会观点出发，如何指导和看到一个城市举办奥运会，是一届奥运会结束之前的工作重心。无论是空气质量还是交通问题，国际奥委会都希望北京在鸟巢奥运主火炬点燃之前交出漂亮数据。“有问题就要解决问题，这是国际奥委会和北京奥组委需要共同面对的问题。”于再清继续说道，“北京在空气质量问题上已经做了很多工作。是排污企业能源结构问题的，也都提前迁厂加以升级改造。另外一块儿则是市区内施工工地扬尘和汽车尾气导致空气中悬浮颗粒较多超标，就已经确定奥运会之前市区工地全部停止施工，汽车则是要在奥运前便施行单双号出行的规定，进而减少汽车尾气的空气污染。”另外，于再清还介绍说，奥运期间北京将特别设置奥运专用通道服务，以完全保证北京奥运会的交通顺畅。“奥运会一定会促进北京的基础建设、城市文明等多方面的快速发展，因为奥运人文、社会和体育遗产会直接作用在北京以及周边地区的。当然，在北京举办奥运会，也是直接影响着整个中国，这也让奥林匹克精神第一次这样大的影响到世界上最多人口的国家，最受益的是奥林匹克。”于再清认为奥运会和北京的相互作用结果，是双赢。

因在国际奥委会的特殊位置，这也让于再清备受关注，也有人认为他是中国在国际奥委会中继何振梁之后的重量级人物和话语代表。“其实这些都是误解，我在国际奥委会的职务不是分配的，也不是中国派我过去的。国际奥委会不是政府组织，而是一个私人俱乐部，在国际奥委会工作，只需要也必须遵循奥林匹克宪章。”于再清如此解释自己的多重身份，他也坦言自己责任也是更多。

话题转到中国武术时，于再清告诉记者，“武术进入奥运会正式比赛项目，至少要到2018年以后。就各方面情况来看，我认为武术进入奥运会还需要更长的路要走。”于再清透露说，2005年时国际奥委会曾在新加坡举行过一次奥运会新项目增加的投票，“在申请的五个新项目中，分别是高尔夫、7人橄榄球、轮滑、壁球和空手道，里面根本就没有武术的名字。结果投票之后，连那五个项目都没有一个超过半数票，更别说武术了。”于再清分析说，“现在武术进入奥运会时机还不成熟，我们每一个武术工作者都要做更多工作。”

“我们现在也不要把武术发展目标只限定在奥运会上，而是应该把武术的影响力扩大到全球。当有一天我们选手参加世界武术比赛时，拿金牌很困难、甚至拿不到金牌，那才是武术的成功，因为世界各国武术实力都增强了。”于再清同时透露说，“2008北京奥运会武术比赛的金牌奖励，很可能不会低于其他奥运项目的金牌，而且这个比赛成绩将带入随后的全运会总成绩里。”

在观看完国家散打队训练之后，于再清还参观和检查了运动员的宿舍与食堂。“陕西地方的同志很照顾你们呀，各方面条件都十分优待。”随后在与教练员和运动员座谈时，于再清鼓励说，“国际奥委会已经是开了很大的口子了，让2008北京奥运会武术比赛在北京奥运会期间举行，这在以前是没有前例的。希望大家全力备战，让世界观赏和分享到武术的魅力。北京奥运会世界看中国，北京奥运会中国武术看你们，希望大家努力。”

2022年2月4日，在闭环条件下进行的火炬接力在北京奥林匹克森林公园南园举行，于再清担任火炬手参与火炬传递。

纵观巴黎奥运会，中国体育代表团的成绩固然令人欣喜，但难免有遗憾之处。在传统“三大球”项目上，中国队整体表现不尽如人意。其中，中国女排止步八强，中国女篮小组出局，而在其余项目上均未获得参赛资格。

于再清认为，中国“三大球”成绩不佳的根源在于项目人口不足，选材范围受限。他以足球为例指出，不仅中国足球人口极少，且选手技术水平与欧洲球员相比差距较大。

于再清还谈及近日中国男足0:7负于日本队的比赛，“输得多了一些，球迷对此有意见。但目前而言，我们确实技不如人。你让队伍拿很好的成绩，那是难为他们。”在他来看，重视项目普及程度，这是提升“三大球”成绩的必由之路。

批周洋

“感谢你爹你妈没问题，首先还是要感谢国家。”2010年3月，国家体育总局副局长、国际奥委会副主席于再清参加全国政协体育界别分组讨论，谈起有运动员夺冠后感谢父母，于再清说：“小孩儿有些心里话没有表述出来”，运动员得奖感言“说孝敬父母感谢父母都对，心里面也要有国家，要把国家放在前面，别光说父母就完了，这个要把它提出来。”他表示，要加强对运动员的德育。