1928年11月17日，蒋亦元出生于江苏省常州市，儿时在觅小就读，后入正衡中学学习。

1950年，蒋亦元毕业于金陵大学农业工程专业，同年10月到东北农学院（今东北农业大学）任教，历任东北农业大学农机系（工程学院）助教、讲师、副教授、教授、博士生导师。

1956年，蒋亦元加入中国共产党。

1957年－1959年，蒋亦元在苏联师从荣誉院士列多希聂夫教授进修。

1982年－1983年，蒋亦元在美国密执安州立大学访问深造。

1997年，蒋亦元当选为中国工程院院士。

2020年2月24日16时18分，因病医治无效在哈尔滨逝世，享年92岁。

蒋亦元突破了国际公认难题，创造出割前脱粒水稻收获机器系统，取得国际首创国际先进的成果；创制摘脱同时切割搂集秸秆成条铺的快速水稻（小麦）联收机，解决了国内外不能在脱粒同时收秸秆和落粒损失大的难题，并研制出气吸式割前摘脱禾本科牧草籽联合收获机；指出了相似理论中G.Murphy的π关系式合成理论中的重大缺点组分方程必须具有相同形式，蒋首次提出并证明可以具有不同型式使预测精度显著提高。