氏源：小野寺（栃木県下都贺郡岩舟町小野寺）的地名的由来通常以“平安末期被称作小野行基的人建立了大慈寺，后改名小野寺。”的说法为主。

滝口的武士藤原义寛出仕源为义转战坂东地区、积功被赐封为小野寺保。于是义寛一般被认为是小野寺氏的始祖。其他同名的小野寺氏大多是从平安末期到鎌仓时代由于合戦的恩赏获得土地后同族人的封地，当时小野寺一族鼎盛之极，主要有奥州小野寺、出羽小野寺、仙北小野寺、下野小野寺、新田小野寺等。

出羽小野寺是小野寺氏的本家，本来的领地是下野小野寺。由于小野寺的地方狭隘、水旱田的开发都相当困难，于是便归并了本流的小野寺分家——新田小野寺氏的领地。南北朝战乱时期因获得功勋，成为了足利氏的扶持众（亲幕府的国人众），使新田地区卷入战乱，而迁居出羽。