北京大学鄂尔多斯能源研究院旨在开展能源转型和碳中和愿景的关键科技创新研究，促进科技成果转移转化，培育孵化科技企业，培育创新人才。力争五年内，建成全国一流高水平能源研究院。

北京大学鄂尔多斯能源研究院是由鄂尔多斯市人民政府出资，依托北京大学建立的集专业高端智库、技术研发中心、成果转化平台、人才培养基地、创新创业空间和高新技术企业孵化器于一体的“双碳”特色新型研发机构。

该研究院实行领导小组领导下的院长负责制。领导小组实行“双组长制”。