亨利在还是共治国王时就在德意志诸侯怂恿下反对他的父皇亨利四世。他的第一次反叛以失败告终，但他终于在1105年推翻了父亲并一度将后者监禁。

虽然教皇是亨利五世篡位的最主要支持者之一，亨利五世在主教叙任权之争上并未比亨利四世有任何软化。当教皇帕斯卡尔二世拒绝为他加冕时，他进军罗马（1110年），监禁了教皇和大部分枢机。教皇暂时屈服，但不久收回其对亨利五世作出的全部让步。1116年，亨利五世第二次侵入意大利，将帕斯卡尔二世赶出罗马（1117年）。当帕斯卡尔二世去世后，他扶植了一名敌对教皇格列高利八世。1122年，亨利五世终于与新教皇加里斯都二世达成妥协，在沃尔姆斯宗教协定中基本解决了主教叙任权之争，并将格里高利八世废黜。